Ну смотрите. К этой таблице не часто обращаются. Можно сказать в большинстве случаев единожды. А вот ограничение на количество файлов есть. Или все равно не стоит?
̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻̻ ҉, а какую роль здесь играет большое количество запросов? Если запросов к БД SQLite не больше двух одновременных. А там где большое кол-во запросов, вполне достаточно MySQL.