Я строю структуру папок для html-файлов согласно меню: в корне создаю about, service и пр.
Причем для двуязычного сайта (рус/укр) обе версии складываю в одну папку, просто обзываю файлы на нужном языке.
В корне лежит index для основной версии и "название-сайта".html для второй.
