Более-менее стандартный рабочий процесс с использованием Pug подразумевает, что используется какой-либо инструмент сборки или таскраннер вроде Gulp или Webpack, который полностью автоматизирует компиляцию HTML из Pug, как в dev-режиме, так и в build. То есть при грамотной настройке рабочего процесса описанная тобой проблема перекомиляции пропадает.
Актуальность зависит от объёма и характера задач. Простой лендинг или визитку может и не имеет смысла верстать с использованием Pug. На более-менее крупных проектах можно добиться серьезного прироста скорости благодаря упрощённому синтаксису и дополнительным фишкам типа миксинов и функций.
Так что, как и по отношению к любому инструменту, сначала нужно чётко понимать, зачем и когда его следует использовать. Если это понимание не пришло - скорее всего, пока не возникла та ситуация, когда инструмент реально нужен.
