Notice_n

в sidebar.php добавляю следующий код

Либо кавычки уберите вместе с тегом <?php, так как внутри просто кусок хтмл и интерпретировать его не нужно, либо echo добавьте перед кавычками.
Так же, если используете echo, внутри одинарных кавычек строку с одинарными кавычками нужно экранировать, либо заменить все одинарные кавычки на двойные.

<?php echo '<script type="text/javascript">
var container = $("html,body");
var scrollTo = $(".main-block");
container.animate({scrollTop: scrollTo.offset().top - container.offset().top + container.scrollTop(), scrollLeft: 0},300);
</script>';
?>