На каком курсе института лучше всего начинать работу?

На 4 курсе это был C#. Начинать с php и т.д. я вам не советую. Как по мне, лучше потренироваться, набрав опыта в программировании десктоп приложений. Сейчас плавно перехожу на разработку для мобильных систем, язык - Objective-C.