Из 3 языков, C#, Java и C++ сложнее всего декомпилировать C++, так как C++ компилируется в ассемблерный код, тогда как Java и C# в промежуточный (IL) код. Хотя и существуют обфускаторы, которые помогают сильно затруднить декомпиляцию C# и Java. Не до такой степени, как C++, но разбор программ после обфускации может также занять длительное время.

Ну, точнее даже не столько декомпиляцию, сколько понимание кода после декомпиляции.
Хотя хороший обфускатор обломает некоторые декомпиляторы. Но не все.
Опять же хороший декомпилятор поможет сделать код относительно читаемым и после обфускации.
В общем, лучше всего дела у С++ в данном плане, насколько я знаю, но и там они не идеальны.