Как распарсить json строку в SQL запросе и использовать ее для сортировки?

да по сути тут без разницы, какая строка будет удалена, главное, чтобы дублей не было.
временная затычка получилась такая:

REPLACE(SUBSTRING_INDEX(SUBSTRING_INDEX(SUBSTRING_INDEX(resources, ',', 2), ',' , -1 ), ':', -1), '"','') as dist

т.к. рядом с "14": могла оказаться строка ("14": "55") или число ("14": 55) в результате выводится отдельное поле, которое успешно сортируется и благодаря группировке и distinct имеет уникальное значение. Вполне возможно, что с помощью регулярных выражений это все можно упростить.

Не работает пример юнит тестов Phalcon, где ошибка?

Все верно, в документации был описан способ установки через composer и git clone. Последним как раз и воспользовался, а надо было первым 8(

Не работает пример юнит тестов Phalcon, где ошибка?

да, пример из Tutorial 3 работает отлично.

Как лучше кэшировать данные postgresql?

Неве́жество — недостаток знаний, необразованность, отсталость, сопровождающие определённое действие. Все верно, "У начинающих программистов" это обычное явление, если же вы сразу стали гуру, то за вас можно лишь порадоваться. Более того, было бы чудесно узреть статью "Кэширование для чайников" под вашим авторством, в которой были бы ответы на заблуждения, догадки и примеры, в которых данную возможность (не)стоит использовать. А пока что, в ваших словах видится лишь бессмысленный КО.

Как оптимизировать запросы к бд в ZF?

Чтобы уменьшить нагрузку на БД при большом количестве обращений. Потому что тим лид так сказал 8(

Что происходит при выполнении указанного php кода?

Не побоюсь ответить. В конце есть строка из php файла 8)

Игнорирование robots.txt в Zend через htaccess?

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -s [OR]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -l [OR]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -d
RewriteRule ^.*$ - [NC,L]
Работает, спасибо!