NaN

прямой ответ - Да.
Можно их join и прочее.
Но ведь необходимость InnoDB обуславливается не только внешними ключами. Смотрите по ситуации.
Не сильно критичные данные можно запросто хранить в myisam.

Чтобы имитировать реальную ситуацию, с учетом канала, клиента, кешей, статики, https и прочего:
loaddy.com (быстрей, проще)
loadimpact.com