Как объяснить рядовому клиенту, что сайт, сделанный руками, а не на шаблоне, для него будет лучшим выбором?

Мы обсуждаем не это, есть задачи с которыми вполне справится и готовый шаблон. Читайте не то, что Вам хочется прочитать, а все что написано ))) Хотя отчасти я и согласна с Вами, но харлей повезет пиццу быстрее, а значит она будет еще горячей.

Как объяснить рядовому клиенту, что сайт, сделанный руками, а не на шаблоне, для него будет лучшим выбором?

Ну речь не идет о необходимости использования движка. Читайте выше. При необходимости и к своему шаблону можно CMS прикрутить. Речь скорее об адекватности рынка.