Похожая проблема с этим же контроллером Intel 82579V мучала меня, думал что в железке проблема, попробовав накатить Ubuntu и выключить ПК, wake on lan заработал, стало быть проблемы в драйверах windows. Принудительно установил драйвер от Intel 82579LM, выключив пк, wol не заработал. Зашел в свойства драйвера, Wake on Magic Packet стояло enable, поставил disable - ОК - поставил enable - ОК. Ура Все заработало!