Если сторонее приложение поддерживает API, тогда разбирайтесь как оно работает, кидайте запроссы и парсите ответы (модуль json в помощь)
Если приложение не дает API, можно посылать GET/POST запросы (читайте про модуль requests), потом парсить (модуль BeautifullSoup), получать нужные данные и отправлять их боту.
Чтобы имитировать запросы авторизированого пользователя можно посылать нужные куки на сервер.