Не считая очевидного "выбор языка зависит от задачи" и "лучший инструмент тот, которым хорошо владеешь", я бы сказала так:
- excel выкиньте, если вы не богоподобно в нём разбираетесь и решаете более-менее сложные задачи. То есть инструмент хороший, но слишком уж неповоротливый и медленный на больших объёмах.
- из R и Python надо смотреть по области. Первый более математически-ориентированный язык, а второй - более общий. Причём если вместе с библиотеками Python легко сравнится с R по сложности решаемых задач, то наоборот не так всё круто - R явно проигрывает Python по скорости (пруфлинки есть в интернете).
Что касается
почему тот или иной инструмент использует тот или иной bigdata-аналитик?
, то повторю ещё раз - в чём лучше разбирается, что удобнее, то и использует.
Если вы в начале пути и выбираете инструмент - рекомендую Python, у него и сообщество лучше.