1. Перестаньте пользоваться скриптом, который делает невнятные манипуляции с названиями.
2. Подготовьте названия файлов заранее, убрав из них пробелы и кириллицу. Также рекомендуется не использовать кириллические имена каталогов.
4. Положите ваш файл intro.mp4 вне дерева папок с видео, которые хотите обработать.
3. В корневом каталоге того дерева папок, где лежат ваши видео, выполните в командной строке:
for /r %F in (*.mp4) do ffmpeg -i "concat:полный_путь_к_intro.mp4|%~dpF.mp4" -c copy "~dpnF_i.mp4"
Эта команда должна обойти все подкаталоги, для всех mp4-файлов выполнить конкатенацию вашего intro-файла (не забудьте заменить "полный_путь_к" на собственно путь) и каждого найденного файла, сохранить его с именем найденного файла, приписав к нему "_i".