Незнаю как там на кали, но в следующий раз при установке линукса разделяй всё на разделы.Хотя-бы так(размеры индивидуально под себя):
Так, ты сохранишь важные файлы и сможешь заново установить линьку с сохранением файлов:)
Не совсем тебя понял :( Нарисуй лучше)
Во-первых флексы служат для разметки, а не для всякой стилизации по типу фона и т.д.
Во-вторых можно сделать 2 контейнера внутри вашего контейнера и каждый раскрасить так, как вам нужно, не?