Python для научного программирования?

Насколько я помню, она просто делает обертку обычной динамической библиотеки, которую можно подключить и через ctypes

С чего начать изучение python?

Чтобы азы изучить — его достаточно. Дальше можно на официальную документацию перебираться.

Автоматизация скачки файлов с яндекс.диска

Данный пункт не поможет от необходимости тыкать по ссылка. USDownloader успешно справляется с задачей