Итак произвел проверку по перемещению рабочих директорий в новое место. Все замечательно работает.
Добавил в файл idea.properties следующие строки:
idea.config.path=<НОВЫЙ ПУТЬ>/.WebIde70/config
idea.plugins.path=<НОВЫЙ ПУТЬ>/.WebIde70/plugins
idea.system.path=<НОВЫЙ ПУТЬ>/.WebIde70/system
PS
Так же можно не мудрить с настройками и поступить проще, добавив ссылку в ФС, как уже предложил @zxspectr
