Решение проблемы: Нужно снести из Пунто Russian Markdown раскладку и поставить Russian только и тогда будет работать все. Правда раскладка поменяется сама немного и нужно привыкать к новой.
А ошибка такая у меня была - Приложение «PuntoSwitcher» хочет включить сторонний метод ввода Russian Markdown
Пробовал Caramba Switcher но он хуже понимает и глючит! Punto лучше...