Arduino использует тот же интерпретатор С++ что и Atmel studio. Потому есть варианты:
Простой - воспользоваться Arduino IDE и все будет работать так же как и в Atmel studio.
Сложный - модифицировать текст библиотеки и использовать его в среде Atmel studio.
Для проф решений конечно лучше идти вторым путем, но если для общего развития и понимания как работает микроконтроллер - лучше Arduino IDE.
