PHP парсер с поддержкой proxy функции это реально?

все поддерживается

switch (strtolower($URI_PARTS["scheme"])) {
            case "https":
                if (!extension_loaded('openssl')) {
                    trigger_error("openssl extension required for HTTPS", E_USER_ERROR);
                    exit;
                }
                $this->port = 443;
            case "http":

Почему ломается индекс MySQL (MyISAM), и как этого избежать?

Т.к у вас преобладают SELECT, INSERT поэтому InnoDB и не подходит.