Не трогайте термопасту! 99% случаев дело не в ней! С пылью макбук справляется сам (переодически он сильно врубает кулер). Откройте мониторинг системы и поглядите что ждёт ресурсы, после обновления система может захотеть начать индексировать файлы и прочее, ну и как выше сказали - выполните чистую установку.