Да, JSON нецелесообразно менять прямо на диске. Его нужно загрузить, распарсить, заменить значение, потом снова сериализовать данные в JSON и сохранить на диск.
import json
with open('myfile.json') as f:
data = json.load(f)
data['example1'] = 'bye'
with open('myfile.json', 'w') as f:
json.dump(data, f, ensure_ascii=False, indent=4)
