'$(user)'
— это бессмыслица. Во-первых, внутри одиночных кавычек переменные не раскрываются, во-вторых скобки должны быть фигурные (а тут они и вовсе не нужны) Кроме того, ограничение скорости может быть задано в поле “X-Accel-Limit-Rate” заголовка ответа проксированного сервера.