У меня примерно такая же ситуация, только без КД за впн. Freenas подключается только к КД, который указан у него в настройках, так что тот КД, который за впн, роли в данном случае не играет. Попробуй поменять КД в настройках freenas на другой КД в локальной сети, мне помогло. Пробовал переустанавливать проблемный КД, менять сам железный сервер, где крутится ВМ с КД, разницы нет. Заметил, что freenas начинает отваливаться от КД только в определенных ситуациях. Например у меня есть два КД, на разных серверах. При подключении к первому freenas не отваливается, при подключении ко второму начинает периодически отваливаться,но если этот КД физически перенести в другое место, отваливаться от freenas перестает. При этом с другими хранилищами такой проблемы нет. Т.е. есть некоторое подозрение на то, что некие проблемы в локальной сети и дают такой эффект отваливающейся авторизации во freenas.