Так вам шифрование и криптографические протоколы или только SSL?
По первому: Брюс Шнайер - Прикладная криптография. Если вообще интересоваться шифрованием, то это главная книга, которую необходимо прочитать. Лучше в оригинале, перевод сделан не специалистами в области с рядом ошибок.
Дальше опционально уже смотреть что именно интересно. Криптология очень обширная наука, на самом деле, и одним шифрованием не ограничивается.
