Все правильно выдает ошибку, вы пытаетесь установить cheerio как зависимость в саму себя. Не нужно сливать с git архив, просто в пустую папку ставьте через npm install cheerio. Git для этого вообще не нужен.
Вот тут www.phpclasses.org есть интересные классы и библиотеки для PHP, а тут www.jsclasses.org для JS. А вообще это все дело можно смотреть на гитхабе.
