Катя

Причин может быть много.
1. попробуйте выявить какой конкретно плагин вызывает проблему. По очереди активируйте плагины.
2. Когда найдете какой плагин вызывает проблему - почитайте его требования. Возможно не подходит версия пхп, или недостаточно оперативной памяти.

'Синий кит'.indexOf('кит', 5); // вернёт 6
'Синий кит'.indexOf('', 9); // вернёт 9
'Синий кит'.indexOf('', 10); // вернёт 9
Верно ведь. Он возвращает то, где искомый символ.
Вот более наглядно:
'Сикит кит'.indexOf('кит', 5); // вернёт 6
Т.е. В первых 5 не идёт поиск, но их индексы учитываются.

Все правильно получается. Ведь он возвращает позицию символа в переданной строке, а второй аргумент не режет строку, он просто задает начало писка в нужного символа, он не повлияет на возвращаемое значение (только на поиск). Получаете вы именно номер символа в вашей строке.
UPD:
По поводу

'Синий кит'.indexOf('', 9); // вернёт 9
'Синий кит'.indexOf('', 10); // вернёт 9

Тут ситуация в том, что номер начала поиска больше или равен длине строки (в котором ищем). А по спецификации, если искомая строка имеет нулевую длину, а начальный индекс поиска больше или равен длинны исходной строки, то всегда возвращается начальный индекс поиска. Если вы сделаете так:
'Синий кит'.indexOf('C', 10);
То искомая строка уже не с нулевой длинной, и если начальный поиск больше или равен длине строки, то по спецификации всегда возвращается -1.

Надеюсь правильно объяснил, если что, спрашивайте.

Это ссылка на страницу с фото, а не на фото
https://unsplash.com/photos/nvtJoYiIM2Q

Вот ссылка на картинку
https://images.unsplash.com/photo-1494719019271-7b...