Katsimoto

2 варианта.

1. https://github.com/D4koon/WhatsappTray/releases
   UPD. По состоянию на 06.01.2019 последняя рабочая версия, в которой нет проблем — 1.4.3
   
2. https://www.anvir.net/ — при сворачивании с нажатым SHIFT — сворачивается в трей

любое приложение.

зы. Не увидел сразу, что у вас Whatsapp tray 1.3 не работает. Странное поведение, у меня всё ок.
UPD. По состоянию на 06.01.2019 последняя рабочая версия, в которой точно нет такой проблемы — 1.4.3
Удалять не стану — чтобы в будущем из поисковых систем сюда люди могли придти.

final_data.reduce((acc1, num1) => acc1.reduce((acc2, num2) => acc2.concat(num1.map(num3 => [].concat(num2, num3))), []))

Вот это выглядит прям очень нехорошо - acc2.concat следует заменить на acc2.push, нет никакой необходимости в создании нового массива на каждом шаге (и, соответственно, копировании всех его элементов), можно добавлять новые элементы в существующий массив:

final_data.reduce((acc1, num1) => {
  return acc1.reduce((acc2, num2) => {
    acc2.push(...num1.map(num3 => [...num2, ...num3]));
    return acc2;
  }, [])
})

Полученный буфер следующий:
<Buffer 31 32 0d 0a>

Последние два значения это служебные символы (не уверен по поводу предпоследнего)

Решение:

- указать кодировку process.stdin.setEncoding('utf-8');
- обрезать лишние символы input_data .trim()

Стандартные потоки
process.stdin
Пример с использованием readline.

const parts = [
  [0, 1],
  [0, 1, 2, 3],
  [0, 1, 2],
  [0, 1, 2, 3, 4, 5],
  [0, 1, 2],
  [0, 1, 2, 3],
  [0, 1],
  [0, 1, 2]
];
const result = parts.reduce((a, b) => a.reduce((r, v) => r.concat(b.map(w => [].concat(v, w))), []));

console.log(result.map(a => a.join(', ')));

Разработка приложения начинается с разработки ТЗ, как впрочем и любая другая разработка. Вот с этого и начните. Разработка ТЗ включает в себя такие вещи как:

• Требования
  
• Ограничения
  
• Базовые скелеты интерфейса
  
• Сценарии использования
  
• Описание внутреннего функционала
  
• Описание взаимодействия с внешними системами
  

Затем все вот это расширятся в частное ТЗ, где каждый пункт описывается подробно и в деталях, рисуется полноценный дизайн приложения и как оно должно выглядеть. Это называется этап декомпозиции — большая задача разбивается на множество более мелких, а те в свою очередь еще более мелких. Описывается поведение каждого элемента интерфейса и его функционал. Так же описывается взаимодействие со всеми внешними системами и интерфейсы взаимодействия. Например ОС — используемые АПИ, сервисы, файловая система; сетевые сервисы — описание взаимодействия с их API и описание используемых ими данных. Подробно описываются сценарии использования — как пользователь может решить какую-то задачу, используя данное приложение. Разрабатывается структура приложения, его модули и подсистемы, используемые фреймворки и библиотеки. Создаются тесты приложения — отдельных модулей, бизнес-логики, интерфейса, API и прочего. И так далее. Программирование — это лишь одна из составных частей в разработке ПО. И не всегда самая большая.
Вот после того, как напишете полное ТЗ, можно приступать к планированию разработки. В любом случае, вам необходимо ознакомиться с основами программирования (да-да, те самые большие книжки, но в сети полно более коротких туториалов, в т.ч. онлайн), какие существуют языки программирования, почему/чем отличаются и почему/чем похожи и т.д. А далее уже можно потихоньку брать по одной задачке из вашего ТЗ и поэтапно решать.