Создайте на флешке проэкт Vagrant. Установите Vagrant на оба десктопа и запускайте проэкт.
Под капотом -- любой вирутальный провайдер: VirtualBox, VMvare, Docker, etc.
Плюсы: одна и та же среда, можно запускать вебсервер непосредственно в среде, можно фризить виртуальную машину (не нужно перезагружать)
Минусы: время на старт/хальт/рестарт виртуальной машины, изучение конфигов Vagrant, мутки с редактированием кода на дочерней виртуальной машине (шаринг папок, ssh, для нарков -- gvim).
P.S. Слушайте что говорит
gim0 и используйте git.
upd... Трабл с отсутствием ПК можно решить пересев на облачную IDE.
Cloud9 к примеру.