Ref

Взгляните в сторону fsarchiver. Бэкапит как файлы, так и разделы. Из достоинств возможность монтировать архивы как вд.

Скорее всего проблема с переменными окружения.
Шторм не знает где находятся библиотеки или бинарники.
Тип:
#!/usr/bin/bash
PATH=$PATH:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin;
export PATH;
LANG=ru_RU.UTF-8;
export LANG;
LC_ALL=ru_RU.UTF-8;
export LC_ALL;