Я с флешем никогда не работал, но первая ссылка в гугле (http://code.google.com/apis/analytics/docs/tracking/flashTrackingIntro.html) подсказывает что можно добавить компонент для тракинга флэшевых сайтов в сам флэш.

У меня линукс с флэшки не грузился если я SATA контроллер в BIOS ставил как AHCI, а не IDE compatible