Раз подозреваете, что ошибка синтаксическая, то откройте консоль и посмотрите, не выводится ли там что-нибудь. Скорее всего - выводится, да ещё и со ссылкой на конкретный символ конкретной строки.
Я навскидку вижу только лишнюю запятую:
new ymaps.Placemark(<?=$arResult['PROPERTIES']['MAP']['VALUE']?>,);
Дальше надо смотреть что у вас в свойстве выводимом конкретно хранится и как оно отдаётся на страницу. Я.Карты ожидают, что там будет массив координат. Полагаю, что вы вместо массива выводите строку и нужно добавить json_decode().
