HTML5 семантика. Стоит ли размещать ссылки на авторизацию в основной навигации?

Для начала стоит задать себе вопрос, а ссылки на авторизацию - это навигация? По моей логике - это все таки отдельный компонент "авторизация", и стоит его вынести.

Просто это можно окрестить навигацией на страницу авторизации или что-то вроде того. Я не уверен.

Можно сделать по такой иерархии, что у вас есть один стандартный nav, а управлять его отображением можно с помощью родителя - header или footer

Как по БЭМ, да?! Классы "nav header__nav" и "nav footer__nav".