Была аналогичная ситуация, премию вписал в инвойс с наименованием Porject management and communication количество - 1, цена - сумма премии. Ну а так ещё была вторая строчка с PHP development, ценой часа и количеством часов. Вопросов со стороны ВК в Модуле не было.
Не вижу причин, почему не оформить отдельный инвойс на только премию, если хотите получить её отдельным переводом.