Все просто:
1) в телеге делаете приём файла от пользователя, точнее сохраняете его на свой сервер
2) вызываете функцию ваших определённых алгоритмов, и сохраняете на сервере полученный результат
3) в телеге бот шлет ответное сообщение и прикладывает новый файл
Показывайте Ваши наработки, люди помогут
