Jfr0s

Во первых вместо time.sleep используйте schedule, по скольку ваше выполнение через неделю может сожрать гиг памяти. Во вторых, а не проще просто создать переменную и в том случае если она = False просто не выполнять цикл. Можно сделать программу асинхронной, что бы она не завершилась, после указания нечего не делать, и ждала следующих указаний. А и добавь логи с декоратором который будет ловить ошибки, а интервал бери с конфиг файла, который тебе нужно создать. Подозреваю что там очень плохая структура проекта ( не удивлюсь если ты писал всё в одном файле ) Если хочешь, то создай git репу и пул реквест, я сделаю заметки.

Ты не внимательно прочитал документацию schudle, там нужно обновлять информацию каждую секунду

while True:
    schedule.run_pending()
    time.sleep(1)

Полный пример:

def r_check_mes(message):
    x = message.text
    if x == 'Включить':
        schedule.every(2).seconds.do(lambda: job(message))
    elif x == 'Выключить':
        schedule.cancel_job(lambda: job(message))
    while True:
           schedule.run_pending()
           time.sleep(1)