Вот ещё обсуждение: Что выбрать ФИВТ МФТИ или ФУПМ МФТИ
Два минуса, возможно, несущественны:
1. Учился в в МФТИ на ФОПФ в 90-е. Девушек было очень мало (у нас 3 на потоке в 80+, на ФРТК - одна на факультет вообще), и им была халява. Сейчас девушек заметно больше, и как обстоят дела я уже не знаю.
2. До Савёловского вокзала полчаса на электричке.

Хочу написать одну важную, с моей точки зрения, вещь. При выборе вуза стоит задуматься о предполагаемом круге общения. Те люди, в компании которых вы будете "вариться".