Во-первых, запатентовать идею нельзя. Как нельзя запатентовать алгоритм работы вашего сайта. Патентуются только конкретные реализации.
Во-вторых, если идея действительно стоящая, и вы создадите сайт, который потом запатентуете в России, то другие люди могут опередить вас и, украв идею, сделать сайт и запатентовать его в другой стране.
Идеи сами по себе ничего не стоят. Довелось мне поработать с одими ребятами, у которых была супер-идея. Люди приходили в восторг от идеи, народ вкладывал в проект приличные деньги чуть ли не за спасибо. Сделали сайт, хорошо раскошелившись. Забабахали, не задумываясь, 280 000 рублей на авторские права, доменов одних было на 30000 рублей накуплено. Запустились. А реальность показала, что идея, простите за прямоту, — откровенная хуета, а реализация — вообще ппц. Хотя до этого ни один человек не мог предположить серьезных проблем или нестыковок в идее проекта.
Мораль: если вам кажется, что у вас идея на миллион, лучше доделайте сперва проект, посмотрите, как проект пойдет, вложитесь в раскрутку. Если у сайта есть перспективы, вы это поймете раньше конкурентов. Тогда и патентуйте.