Надо переопределить Sluggable слушатель и добавить к нему аргумент с вызовом вашего транслитератора.
Что-то вроде:
<service id="stof_doctrine_extensions.listener.sluggable" class="%stof_doctrine_extensions.listener.sluggable.class%" public="false">
<call method="setAnnotationReader">
<argument type="service" id="annotation_reader" />
</call>
<call method="setTransliterator">
<argument type="collection">
<argument>\path\to\your\Urlizer</argument>
<argument>transliterate</argument>
</argument>
</call>
</service>