У вас в локейгенах нет переменной рут. Он не знает, откуда ему считать и поэтому скорее всего берет корень ФС.
Попробуйте добавить в локейшены или даже в саму секцию server строчку root /var/www/html
или где у вас атм проекты лежат...
Вот что говорит официвльная документация:
Если location и последняя часть значения директивы совпадают:
location /images/ {
alias /data/w3/images/;
}
то лучше воспользоваться директивой root: