Ihor Gevorkyan

<button class="btn btn-default btn--reset">Button</button>

.btn--reset {
    background: none
}

Важно: этот css должен выполняться после css boostrap-а. Не понимаю только, почему нельзя просто удалить, например, как в этом случае, btn-default из html, у которого указан фоновый цвет.

смотрите в сторону border-color: transparent

frontender.info
https://egghead.io/
www.smashingmagazine.com
tympanus.net/codrops
tutsplus.com

Исходя из ситуации имеется только два варианта - отдать или не отдать исходник. Но, если есть возможность, может, стоило бы обсудить свои опасения с самим директором, объяснить ему ситуацию, свою точку зрения, чтобы дойти с ним до взаимопонимания. А после беседы уже увидите, хотя бы ориентировочно, можно ли доверять человеку или нет (только в случае, когда Вы разбираетесь в людях).

1. Настраиваю gulp на основные таски (конкатенация, минимизация, удаление неиспользуемого, кросс-браузерность, sass и т.д.)
2. Подключаю через bower необходимые "модули", например, normalize.css или фрэймворк
3. Выстраиваю архитектуру кода (просто независимые блоки в отдельную директорию, например, "modules", или "pages" для стилей особенностей отдельных страниц), в корне css главный файл стилей, в котором осуществляется импорт всех модулей (например, файл с переменными цветовой палитры или файл с mixin-ами).
4. Подключаю необходимые шрифты, в основном, через специальный миксин.
5. В главном файле стилей описываю основные стили для типографики, в общем всё, что связано с селекторами типа.
6. Если дизайнер предоставляет styleguide, то начинаю верстать страницу именно с него, а именно, по независимым блокам (где это возможно, от меньшего к большему) используя БЭМ методологию.
7. По ходу дописываю задачи для менеджера задач, например, для скриптов или картинок, собираю необходимый package.json, bower.json.
8. Собственно этап по-блочной верстки.
9. Собираю конструктор из готовых блоков и элементов соответственно макету.
10. Проверяю кроссбраузерность, pixel perfect.
11. Этап исправления деталей

Исходя из формулировки вопроса ответ:
поэтапно, сначала описываю структуру одного блока, пишу ему стили, перехожу к следующему.