Где-то на Хабре была статья, о проблемах клонирования Windows. Что-то связанное с тем, что при инсталляции генерятся ID, которые потом используются при идентификации (авторизации?) и могут возникнуть проблемы с безопасностью, если они в одной сети. Найти не смог.
Так что Windows® Automated Installation Kit (AIK), как посоветовали уже — единственный полностью правильный вариант, хоть и долго.