Один тормозной HDD может тормозить всю систему. Проверьте только с одним SSD.
Если в биосе установлен режим IDE то переключите его на AHCI.
Проверьте надежность соединения SATA шлейфов на обоих концах. Переключите на другое гнездо мат. платы.
Проверьте загрузку диска и процессора в диспетчере задач, возможно какой-то процесс съедает все ресурсы. Возможно, даже системный, если проблема в оборудовании.
Есть ещё предположение, что у вас не установлен драйвер видеокарты. С ним всегда интерфейс тормозит.
