Hanneman

sudo mysql -u root -p

Вам же 404 возвращает - т.е. по такому адресу такого файла нет.
Если у вас версия 29 и вы ставите 11-ую postgresql, то на их сайте прямо написано:

dnf install https://download.postgresql.org/pub/repos/yum/reporpms/F-29-x86_64/pgdg-fedora-repo-latest.noarch.rpm
dnf install postgresql11
dnf install postgresql11-server

Дистрибутив же Fedora 29 содержит версию 10.
Для ее установки достаточно:
dnf install postgresql-server

А зачем она там, где она не нужна? Зачем мне тратить пространство диска на Gnome с периферией, если у сервера роль, скажем, веб-сервера или на нем, к примеру, крутится Couchbase? Зачем мне графическое окружение?
Хотите сервер с графикой - ставьте любое окружение (GNOME, KDE и пр.). Хотите проброску графики? Не проблема - ставьте VNC и наслаждайтесь.

Да вроде методов вагон с тележкой:

1. Запустить IBM MQ GUI Administrator и посмотреть, кто Consumer.
   
2. Запустить tcpdump на сервере (можно и записать в файл) и посмотреть что происходит на портах 5672 и/или 5671 (топорный метод, но из трафика можно отфильтровать по имени очереди в Wireshark, если файл создали).
   
3. Запустить tcpdump клиентских компьютерах и посмотреть кто на тот ваш IP соединяется (если важно условие, что остальные нет, но ищем того кто соединяется).
   
4. nestat и смотреть порты
   
5. На firewall вашей огранизации посмотреть трафик, кто изнутри на тот IP создает соединения
   

Это первое что пришло на ум.

Используйте штатный logrotate.

Запустите от пользователя root (ну или через sudo) и наблюдайте за трафиком:

tcpdump -vvv -i any port 80

Это самый банальный пример для tcpdump с минимальным количеством опций. Если нужно что-то добавить или изменить (порт, например) - в сети масса примеров.

Защита стоит на User Agent. Обманите элементарно, выдав wget за браузер с помощью:

wget -U "Mozilla/4.0 (compatible; MSIE 6.0; Windows NT 5.1; SV1)" "http://hummerxclub.com/forum/viewtopic.php?f=22&t=8129"

Какая разница из какой системы через консоль к удалённому серверу подключаться, если при работе будете находиться в среде того самого сервера? Ставьте Putty и подключайтесь.
И вообще, ваш вопрос противоречит сам себе. Поставил Linux, но нужен Windows, так как .Net, а поэтому как сделать чтобы Windows был как Linux? Так что у вас за система в итоге?

Лучшее (и лично апробированное): Elasticsearch+Kibana+Logstash.

Через crontab, service, daemon, nohup. Либо как php socket.php &. Вариантов много.

Удалять на удаленной из списка на локальной?
P.S. Пишу специально развернуто (строчка за строчкой, без оптимизации кода и команд), чтобы автору понятно было.

filename='/tmp/my.txt'
filelines=`cat $filename`
for line in $filelines ; do
    echo $line
    ssh remote_host_username@remote_hostname_or_ip "rm -rf $line; exit"
done

Между хостами надо настроить авторизацию без пароля (раз уж скриптом собрались делать), чтобы его каждый раз не вводить - читать здесь (пункты "Управление ключами", "Копирование ключа на сервер", "Ключ сервера", или поищите другое руководство по настройке - их миллион в сети). И в этой же статье найдете пункт "Удалённое исполнение кода", если хотите изучить больше, как решается ваша задача.

P.P.S: Само собой, чтобы каждый раз не подключаться по ssh к хосту в итерации (как в моем примере), оптимальнее копировать скриптом локальный файл на удаленный хост командной утилитой scp (в той же статье описание - всего одна строчка команды), потом с локальной тем же скриптом (следующий шаг) удаленно запускать скрипт на удаленной машине, который, читая из скопированного же туда на удаленный хост файла (для него - локального уже) строки, будет стирать файлы локально. Для этого мой скрипт, что приведен выше, нужно модифицировать - добавить пару-другую строк. Но это уже вы сами. Удочка у вас уже в руках - ловите рыбу.

Ошибку в студию.

Попробуйте так:

sudo apt-get remove --purge mysql* -y
sudo apt-get autoremove -y
sudo apt-get autoclean

Затем удалите папку с конфигурацией:
sudo rm -rf /etc/mysql

Ну и затем хардкор: найти все оставшиеся файлы по маске и удалить:
sudo find / -iname 'mysql*' -exec rm -rf {} \;