Как переписать код с c# на js?

На выходе такой же объект как и стандартный document (window.document) (так что лучше использовать другое название переменной), и, естественно, у него есть метод querySelector.
И да, этот код для браузерного JS.*

*Чью работоспособность можно проверить прямо здесь, открыв консоль DevTools'а.

Как поменять favicon на чужом сайте, чтобы в закладке браузера отображалась другая иконка?

SOTVM, можно и вставить HTML, но старые link будут мешаться*, придется удалить их сначала:

document.querySelectorAll(`head > link[rel="icon"]`).forEach(element => element.remove());        
document.head.insertAdjacentHTML("afterBegin", `<link href="https://s.imgur.com/images/favicon-96x96.png" rel="icon" type="image/png">`);

*На самом деле, скорее всего, надо просто заменить href у того link элемента, который выбрал браузер (ибо их тут на выбор аж 15), но лень с этим разбираться.

Как поменять favicon на чужом сайте, чтобы в закладке браузера отображалась другая иконка?

SOTVM, фавайконы для закладок берутся из файла `Favicons`.

Вот таким образом (у Хромиумов):
chrome://favicon/size/16@2x/https://toster.ru/q/667182

Если изменить фавайкон с помощью, например:

document.querySelectorAll(`head > link[rel="icon"]`)
        .forEach(element => element.href = "https://s.imgur.com/images/favicon-96x96.png");

И создать закладку – у закладки будет измененный фавайкон, но до первого захода на сайт.
И чтобы вернуть измененный, нужно опять запустить юзерскрипт. И так каждый раз, так как браузер кеширует последнюю версию, и использует ее для закладок.

Как поменять favicon на чужом сайте, чтобы в закладке браузера отображалась другая иконка?

Mikhail Osher, это делается юзерскриптом в две строки.

document.querySelectorAll(`head > link[rel="icon"]`)
        .forEach(element => element.href = "https://s.imgur.com/images/favicon-96x96.png");

Как поменять favicon на чужом сайте, чтобы в закладке браузера отображалась другая иконка?

Иконка опять обновится на прежнюю после захода на сайт.
Чтобы в кеше браузера была всегда измененная иконка, нужно юзерскриптом все время ее заменять после каждого захода на сайт. Или заблокировать ее загрузку (запрос) с помощью uBO, чтобы браузер не изменял на свежескаченную.

Как вставить исключение в регулярное выражение JavaScript?

/(?<!circle).*\.(jpe?g|png|gif|svg)$/

Почему сайт через Brackets выглядит не так как через Github? Он совсем не так должен был выглядеть: savkinasite.github.io?

Уже писали в других ответах, изображения должны быть в папкe (/img/works/) на гитхабе.

Почему при клике обработчик не срабатывает?

Перемести скрипт вниз, либо запускай по DOMContentLoaded.

Так ли страшно использовать 1024 ключ RSA?

grabbee, хоть для HMAC использовать MD5 безопасно (всеми любимая фраза "MD5 is broken" это про другой юз кейс), рекомендуется использовать SHA.
https://en.wikipedia.org/wiki/HMAC#Security

SHA-256 не сильно медленнее работает.
https://automationrhapsody.com/md5-sha-1-sha-256-s...

А на jwt.io даже и нельзя для примера выбрать данный режим (SHA-1, кстати, тоже).

Так ли страшно использовать 1024 ключ RSA?

Максим Мосейчук, там используется имитовставка на основе хеш функции.
https://en.wikipedia.org/wiki/HMAC
https://ru.wikipedia.org/wiki/HMAC

JWT токены генерирует сервер и он же их проверяет. Секретный ключ только у него.
https://stackoverflow.com/questions/7010786/url-si...
> Нельзя сделать подпись с помощью только MD5.
Получается, можно.