php cli - возможность работы с командной строки;
cgi - один с режимов работы;
fpm - современный движок для ускоренной работы (его можно подключать к nginx напрямую, кстати; главный недочет - не работают старые правила htaccess);
модуль apache - соответственно, работа в качестве модуля.
Для вашей цели нужно ставить модуль для Apache, он потянет за собой все необходимые зависимости. Потом уже в случае чего доставите необходимые модули php (такие как pdo, gd, если они не установятся сами).
