Если ты один единственный специалист, то ты должен провести аудит. После того, как ты проведешь аудит, ты должен предоставить на имя генерального директора служебную записку с комментариями к отчету и предложениями. Сохрани себе копию отчета и зарегистрируй служебную записку, и копию тоже себе. В служебной записки отдельным пунктом, должно быть написано о ВСЕХ нелегальных версиях ПО, которые ты нашел. Следующий документ, это еще одна служебная записка с планом мероприятий по лицензированию ПО или перевод ПО на его бесплатные аналоги. Следующий шаг. Если в течение нескольких дней (не стоит с этим тянуть) план по лицензированию не утвержден и не начались закупки, то ты пишешь заявление на увольнение по собственному желанию.

Документ об аудите и служебная записка об обнаружение не лицензионного ПО, не дает ни кому, в том числе и суду, считать, что вы в сговоре.

Из рекомендаций, даже под предлогом увольнения не устанавливай сам не лицензионное ПО. Если ты не хочешь делать аудит и писать служебные записки, о том, что найдено не лицензионное ПО, то просто увольняйся.