Gadd

Запустите сначала файл не через панель Unity, а из наутилуса (или через терминал).
(Toolbox у вас виден не как приложение, а как обычный файл)

В ubuntu (12.04 как минимум) есть встроенная утилита deja-dup. Гуй доступен через "Параметры системы". Можно пользовать и через консоль.
Поддерживает копирование в папки, в сетевые сервисы и пр.

Если нужно просто иметь копию папки в бекапе, то можно использовать всё что описано выше. От себя добавлю "синхронизатор" Conduit