Используйте метод расширение
WithConstructorArgument:
this.Bind<IRictagle>()
.To<Rictagle>()
.WithConstructorArgument("a", a)
.WithConstructorArgument("b", b);
Если не хотите использовать параметры на уровне создания связей ядра - реализуйте свой провайдер:
abstract class NinjectProvider<T> : IProvider
Ну вообще получать экземпляр напрямую из ядра не ок, делайте сразу правильно, даже если это обучающий пример:
1. Создаем
NinjectDependencyScope и реализуем интерфейс
System.Web.Http.Dependencies.IDependencyScope.
2. Создаем
NinjectDependencyResolver и реализуем интерфейс
System.Web.Http.Dependencies.IDependencyResolver.
3. Создаем
NinjectRegistrations и реализуем абстрактный класс
Ninject.Modules.NinjectModule.
После этого класс сам подхватит зависимости из ядра и Вы сможете пользоваться своим экземпляром класса.