GGHotDog

Вероятно, столбец user_id имеет тип integer, а ты вставляешь текст "usser_id", тебе нужно вместо "usser_id" вставить id который тебе нужен, т.е

user_id = 1
cursor.execute(f"SELECT * from DANON WHERE user_id = {user_id}")

Функция open имеет несколько аргументов, такие как:
'w' - write(которая как ты говорил полностью сносит всё что в файле)
'r' - read(читает файл)
'a' - Откроет для добавления нового содержимого.
Это основные, есть ещё и для чтения бинарников, такие как 'wb'

Соответственно можно это реализовать с помощью записи в файл:

r = []

def getList():
    r = []
    f = open('test.txt','r')
    for i in f:
        r.append(i.replace('\n', ''))
    f.close()
    
    return r

def addFile(v):
    f = open('test.txt','a')
    f.write(v + '\n')
    f.close()
    pass

r = getList()
print(r)

v = input('Введите слово/')
r.append(v)
addFile(v)
print(r)

Не забудь создать в директории файл test.txt, или можешь сделать чтобы программа проверяла его на существование и создавала если его нет