На самом деле универсального способа, а ля кнопки "сделать хорошо", не существует, поэтому и нет набора на все случаи жизни. Обычно стараешься сначала разобраться что человек вообще сделал, посмотреть что за проблема и решить её наиболее подходящими в конкретном случае инструментами. Чаще всего удобнее работать через TeamViewer, что сразу позволяет увидеть и лично исправить ту или иную вещь.
Диапазон программ широк настолько же, насколько и проблем, то есть практически бескрайний. Хотя, на счёт общей профилактики может помочь нормально настроенный CCleaner, насколько возможно скрытый от глаз пользователя, чтобы не было шансов навредить, удалив что не надо, поставленный в "Планировщике задач" на автоочистку по расписанию. Для случайно удалённых файлов подходит Recuva, главное не трогать ничего лишнего при восстановлении, и не записывать на тот же диск, а то можно потерять файлы навечно. Браузер лучше приучить запускать через Comodo Sandbox или Sandboxie, чтобы избежать не малой части проблем. Естественно, антивирус, фаервол, все основные библиотеки и драйвера принимаются как само собой разумеющееся.
Однако, если же руки у человека, допустим, совсем кривые, то иногда ему будет проще "заморозить" систему при помощи той же Toolwiz Time Freeze. Программа запускает всё в стиле виртуальных машин и в таком случае с ней можно делать практически всё что угодно, так как после перезагрузки или отключения всё вернётся в исходное состояние, не считая некоторых выбранных исключений. По понятным причинам такую такую конфигурацию довольно проблематично убить, но она подходит не всем.